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刘善虑团队:目前主流新冠毒株横扫欧美,关键是这个因素;Topol博士:一个更凶险的毒株,正在从德国蔓延
2024-11-12 01:22

摘要:

刘善虑团队:目前主流新冠毒株横扫欧美,关键是这个因素;Topol博士:一个更凶险的毒株,正在从德国蔓延

本次推送内容包括:

1)报告美国刘善虑教授团队的最新研究:目前欧美主流毒株的突变特点,及人群对其中和活性的急剧降低;

2)Eric Topol博客警告:要警惕正在从德国蔓延开来的新冠XEC突变株。

一,JN.1子代成为新毒王

刚刚过去的暑假,美国再次出现流行性极广的新冠感染;很多朋友再次感染。

新冠病毒极强的突变能力及由此产生的免疫逃逸,继续拨动着医学生物学家们的神经,也让我们普通人不得不关注:新冠病毒及其引发的COVID-19,到底怎么样了?

我们先来看一组数据:美国废水中新冠病毒浓度

这是反映新冠病毒感染情况的客观指标。

可以看到,2024年夏季废水中新冠病毒浓度,是新冠流行以来出现的五个高峰之一。

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废水中新冠病毒浓度很高,意味着新冠病毒感染率很高。

为什么2024年暑假,新冠病毒感染率这么高?

是因为KP.1及其子代出现了全新的突变。2024年8月31日,美国CDC更新的数据显示,新一代新冠毒株KP.3.1.1的占比达42.2%,成为最新的毒王;同时,KP.2.3占比为14.6%,KP.3占比降低到了14.2%,LB.1占比13.5%。

仅前四个毒株,就占到了检出毒株的87.6%!

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(美国新冠病毒最新流行毒株。图源:美国CDC)

从进化看,KP.2和KP.3都是JN.1后代、后者来自于BA.2.82(区别于上一个大流行的XBB毒株);是Omicron毒株的后代。从抗原性来说,KP.3.1.1距离Omicron的距离、已经超过Omicron距离原始毒株的距离。

这解释了为什么疫苗或者我们既往感染已经不能再预防新冠感染【2】。

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JN.1子代到底出现了哪个关键的突变,导致了其免疫逃逸?

美国刘善虑团队于2024年9月4日在线发表在bioRxiv预印版的研究论文,给出了答案【3】。

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本研究主要关注JN.1突变株及其子代亚型,如LB.1、KP.2.3、KP.3和KP.3.1.1,旨在评估这些变种对中和抗体(nAb)的逃逸能力、感染性、融合能力和稳定性。

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A,抗体逃逸与感染性: 

研究表明,JN.1子代在中和抗体的逃逸方面表现出极高的效率,尤其能够逃逸XBB.1.5毒株为抗原的疫苗接种诱导的中和活性。

这些变种主要通过一个位于刺突蛋白N端域(NTD)的单一丝氨酸缺失(DelS31)突变,增强了病毒对中和抗体的抵抗力。

B,病毒稳定性增强: 

DelS31突变还提高了病毒的结构稳定性,使得病毒能在较高温度下保持感染活性。此外,该突变还降低了病毒通过刺突蛋白介导的细胞-细胞融合活性。

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刘善虑教授特别强调:

新冠病毒S蛋白 NTD 上DelS31 突变引起在lKP.3.1.1,KP.2.3和LB.1在过去几周很快横扫美欧的原因。一个single mutation, 尤其在NTD能引起超过9倍的中和抗体下降超过9倍,非常少见。

除了免疫逃避,病毒spike构象稳定性增加和耐温也很重要,尤其是其能够在夏季流行的重要因素。

这项研究强调了更新COVID-19疫苗的必要性,建议加入包含DelS31突变的抗原,以更有效地应对新出现的变种。

二,警惕XEC突变株

当JN.1子代肆虐的同时,Eric Topol博士也在推特中对另一个更新的突变株XEC发出警告【4】;该毒株首先在德国被鉴别出来,并呈现快速增长的特征。

XEC是新冠病毒KS.1.1和KP.3.3两个突变株再重组而形成的新毒株【5】;与KP.3.3.1不同,XEC没有S31的缺失,而是多了T22N和F59S两个新突变【6】。

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目前尚无太多XEC在全球流行的报告。也许本周五美国CDC的报告会给出一些XEC流行的线索:即XEC是否比KP.3.3.1有更强的流行趋势。

因为这影响着今年秋冬季的疫苗接种选择。

如果XEC无法替代KP.3.3.1及其子代,则为了应对今年秋冬季的流行毒株KP.3.3.1及其子代,优先选择辉瑞-BioNTech或Moderna的基于KP.2的mRNA疫苗;

如果XEC成为主流毒株,则不需要关注有S31缺失抗原的疫苗,Novavax的基于JN.1的蛋白疫苗会更受青睐。

如果今年暑假感染过了(大概率是KP.2及以后毒株),则选择Novavax蛋白疫苗也许是不错的选择,这也是大部分关注新冠疫苗学者的推荐【7】。

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我们会继续保持关注,提供最新的新冠相关科学报告和数据。

也祝您和家人都健健康康!

参考文献

【1】 https://www.cdc.gov/nwss/rv/COVID19-nationaltrend.html

【2】 https://erictopol.substack.com/p/the-indomitable-covid-virus

【3】 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.04.611219v1

【4】 https://x.com/EricTopol/status/1829905374583181806

【5】 https://public.tableau.com/app/profile/raj.rajnarayanan/viz/TrackingSARSCoV2LineageXEC-Globally/XEC

【6】 https://twitter.com/LongDesertTrain/status/1830250139983794306

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